きょうだいを登録する時に、間違えて同じ子どもを２回登録してしまいました。子どもの削除はできますか？

ご自身で削除が可能です。園に承認されている状態では削除できませんので、園（管理者）より退園処理をしてもらい、その後、操作を行ってください。また承認申請を出している状態でも削除は出来ません。
保護者より申請を取り下げてから操作を行います。